创新是1号店的基因，自从创业之初，1号店就引领行业风气之新，孵化了大量创新项目。早在三年前，1号店就开始尝试社交购物，跟门户网站、社交网站、游戏网站合作，把1号店植入其中，“我觉得这个尝试在当时为1号店获得了很多的机会”1号店董事长于刚说。此后，1号店的“店中店”、“医网”、“药网”、“虚拟超市”等创新项目先后出炉。像“1页购”，就是1号店根据顾客需求、顾客过去的搜索、购买、收藏行为等“互联网痕迹”，通过大量的数据挖掘，建立顾客行为模型，推出“1页购”功能，让顾客在一个网页上面将所有购买需求一站式搞定。
在创业之前，于刚曾经服务过两家公司，戴尔和亚马逊。他认为，戴尔是执行力很强的企业，但是创新是欠缺的。亚马逊是全球最具创新的企业，因此保证了其高速的增长。1号店的榜样正是亚马逊，然而，在激烈竞争的电子商务领域，一家创业公司如何在机制和文化上推动内部创新呢？在深圳电子商务峰会的发言中，于刚分享了1号店的创新之路。
投入
1号店30%的营收将投入创新和IT建设。据了解，2011年，1号店取得年销售额27.2亿元的成绩，较2011年的8.05亿，增长超过3倍。这意味着接近10亿元将投入创新了IT建设之中。
不怕犯错
于刚认为，要创新首先不要怕犯错，因为所有新的东西，一定是有成功的几率，好的想法和好的做法，大多数人已经做过了，你要适应新的想法。1号店也犯了很多错误，比如上线之前，2008年筹备了三个多月的时间，做一个非常精美，300多页的LOGO，但后来觉得不对，忍痛停止。
专门成立创新团队
目前这个团队有十几个人，预计今后可达上百人。这个创新团队任务是，把业界好的想法、做法，以及1号店自身的原始创新想法进行尝试执行，。号店重视创新人才，“1号店全公司仅有的三个总裁特别奖，其中一个名额就是创新奖，专门鼓励最创新的员工”。于刚表示，1号店不会过多地去用考核来束缚团队的创新想法，而是去激发团队做更多的尝试。
创新流程
针对创新机制的操作模式，于刚表示，1号店一般是团队所有人都可以提出自己的好想法好点子，企业把这些好点子进行孵化，等到孵化到一定程度，一旦创意的潜力展现了出来，就会把这个项目开始转移到正式的项目团队，把它作为一个项目来管理，这个时候就会加大投入，一步一步地推出来。而且，推出来后，产品也会不断迭代优化，一代代地更新。